Біологічна експертиза досліджує об'єкти рослинного та тваринного походження. Ними найчастіше бувають:
листя, стебла, квіти, сіно, солома, кора, деревина, коріння, плоди, насіння, зерно, спори, пилок тощо;
похідні шкірних покривів тваринного походження (волосся, пір'я, луска тощо);
продукти переробки рослинних та тваринних організмів (корми для тварин та птахів, борошно, шматки хутра та шкіри тощо);
продукти життєдіяльності рослинних і тваринних організмів (мед, камедь, екскременти тощо);
біологічні сліди людини та тварин, біологічний матеріал живих осіб та трупів, які містять клітини з ядрами: кров, сперма, букальний епітелій, слина, піднігтьовий вміст, кістки і зуби, волосся з цибулиною, личинки комах, пупарії, цитологічні препарати.
Основними завданнями біологічної експертизи є:
установлення належності об'єктів тваринного та рослинного походження (далі — біологічне походження) до конкретного біологічного таксона (родини, роду, виду тощо), а також виявлення мікрооб'єктів зазначеного походження в будь-якій масі або на предметах обстановки місця події (предметах-носіях);
установлення спільної родової (групової) належності декількох порівнюваних об'єктів;
установлення належності об'єктів біологічного походження до одного цілого;
визначення біологічних характеристик стану об'єкта, у тому числі зернових та зернобобових культур (стадії розвитку організму, причин та часу змін його стану, механізму пошкодження тощо);
встановлення належності біоматеріалу (крові, слини, сперми, волосся, органів, тканин та окремих частин тіла) конкретній особі або виключення такої належності;
ідентифікація особи;
встановлення статевої належності біологічних слідів і об’єктів;
встановлення спорідненості (родинних зв’язків);
визначення ДНК-геному тварин та їх породний генотиповий склад.
Орієнтовний перелік вирішуваних питань:
Яка природа даного об'єкта? Якщо він біологічного походження, то яка його таксономічна належність?
Чи є на предметі-носії (зазначається, якому саме) мікрооб'єкти (частки) біологічного походження? Якщо є, то яка їх таксономічна належність?
Чи мають дана маса (наприклад, зерно в мішку, вилучене в особи) та зразки, вилучені в конкретному місці (наприклад, зразки зерна з певного сховища), спільну родову (групову) належність?
Чи відповідають зразки зернових (зернобобових) культур, що надані на дослідження, вимогам ДСТУ за показниками: масова частка білка; масова частка сирої клейковини; якість клейковини; число падіння; вологість; сміттєва та зернова домішки; сажкове зерно; маса 1000 насінин (зерен) (натура)?
Чи відповідають зразки зернових (зернобобових) культур, що надані на дослідження, за їх характеристиками умовам контракту на поставку?
Чи є дані об'єкти частинами одного цілого (наприклад, гілля та стовбур, дві частини листка рослини тощо)?
Чи могли за певний строк статися ті або інші зміни в розвитку рослинного (тваринного) об'єкта (чи могла рослина за певний час вирости до наявних розмірів, чи могла комаха за певний час досягти стадії розвитку, у якій вона була виявлена, тощо)?
Яка давність заселення трупа знайденими на ньому комахами (личинками комах)?
Чи є волосся, знайдене на предметі-носії (указується, на якому), волоссям людини (тварини)? Якщо це волосся тварини, то чи має воно спільну родову (групову) належність до волосся даної особини?
Який вік рослини, її частин?
Чи належить дана рослина (подрібнені частки рослини) до таких, що містять наркотичні засоби та психотропні речовини? Якщо так, яка її таксономічна належність?
Чи складали раніше дані зразки рослин одну масу?
Чи мають дані зразки рослин спільну родову (групову) належність (за способом виготовлення, місцем вирощування тощо)?
Чи можливо встановити генетичні ознаки наданого на дослідження матеріалу?
Чи є надані на дослідження зразки біоматеріалу генетично дотичними одне одному? Чи збігаються генетичні ознаки?
Чи можливе встановлення наявності генетичних ознак конкретної особи в змішаних слідах біологічного походження?
Чи є наданий на дослідження матеріал з окремих частин трупа генетично спорідненим між собою під час проведення порівняльного аналізу генетичних ознак?
Чи є генетично спорідненими жива людина та труп або його частини?
До якого систематичного виду належить наданий на дослідження матеріал?
Чи містяться біологічні сліди на наданому на дослідження об’єкті?
Чи є спорідненість біологічних змивів з предмета та наданого на дослідження зразка біологічного матеріалу?
Чи є наданий на дослідження біологічний матеріал спорідненим за генетичними ознаками на пупарії або личинці?
Чи належить біологічний матеріал (кров, слина, сперма, волосся, органи, тканини та окремі частини тіла) конкретній особі?
Наведений перелік не є вичерпним. Перед проведенням молекулярно-генетичної експертизи можуть бути поставлені й інші питання в межах предмета експертного дослідження.